MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanoculleus marisnigri JR1 chromosome

Total Repeats: 6568

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009051	TCT	2	6	11	16	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009051	T	6	6	29	34	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009051	T	6	6	59	64	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009051	TTC	2	6	73	78	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009051	TC	3	6	106	111	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009051	TC	3	6	129	134	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009051	T	6	6	144	149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009051	TGAA	2	8	219	226	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009051	AC	3	6	231	236	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_009051	TCA	2	6	246	251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_009051	C	6	6	319	324	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12	NC_009051	CCTGC	2	10	440	449	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
13	NC_009051	CTC	2	6	454	459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_009051	TGT	2	6	3496	3501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009051	CTG	2	6	3672	3677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_009051	CCTG	2	8	8537	8544	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_009051	AT	3	6	8611	8616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009051	CCGG	2	8	8689	8696	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_009051	GCC	2	6	8741	8746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_009051	CAAA	2	8	8758	8765	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_009051	CGGA	2	8	9825	9832	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_009051	GA	3	6	9849	9854	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009051	CGCGTT	2	12	9864	9875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_009051	ATT	2	6	10339	10344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009051	AGC	2	6	10454	10459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_009051	GAG	2	6	10775	10780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009051	GCG	2	6	10793	10798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_009051	ACAGG	2	10	10819	10828	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_009051	ACA	2	6	11785	11790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_009051	CA	4	8	14554	14561	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_009051	CTCC	2	8	14633	14640	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
32	NC_009051	TGTCAA	2	12	16414	16425	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_009051	GGCGG	2	10	16834	16843	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
34	NC_009051	GCC	2	6	16848	16853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_009051	GCGGG	2	10	16926	16935	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
36	NC_009051	TTAACA	2	12	16971	16982	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_009051	TAA	2	6	17003	17008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009051	TTC	2	6	22514	22519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_009051	ACA	3	9	22641	22649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_009051	CGG	2	6	22661	22666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_009051	CCG	2	6	22670	22675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_009051	CCG	2	6	22737	22742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_009051	GGGC	2	8	22795	22802	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
44	NC_009051	AT	3	6	22823	22828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009051	TTTA	2	8	22852	22859	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009051	CGAT	2	8	26864	26871	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_009051	CTC	2	6	26911	26916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_009051	CCG	2	6	28263	28268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_009051	GTT	2	6	28302	28307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009051	GAAA	2	8	28314	28321	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009051	ATA	2	6	28359	28364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009051	TTCT	2	8	28443	28450	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_009051	GAC	2	6	28472	28477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_009051	CGT	2	6	28478	28483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_009051	GGCA	2	8	28522	28529	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_009051	CT	3	6	28579	28584	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_009051	AGG	2	6	28595	28600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009051	GT	3	6	29340	29345	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009051	TCC	2	6	29353	29358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_009051	GGGA	2	8	29360	29367	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009051	TTG	2	6	29436	29441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009051	TGT	2	6	29452	29457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009051	CCG	2	6	29477	29482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_009051	T	7	7	30724	30730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009051	TTCA	2	8	34395	34402	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_009051	TCC	2	6	34403	34408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_009051	TAA	2	6	34533	34538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009051	AAC	2	6	34572	34577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_009051	TCC	2	6	39440	39445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_009051	CT	4	8	39452	39459	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_009051	GATT	2	8	39504	39511	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009051	CCGGAT	2	12	41278	41289	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_009051	TCG	2	6	41306	41311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_009051	CCGCGC	2	12	41369	41380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_009051	A	6	6	41407	41412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009051	TCC	2	6	43458	43463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_009051	CGG	2	6	43526	43531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_009051	CCG	2	6	45012	45017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_009051	G	6	6	45058	45063	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009051	CAC	2	6	45094	45099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_009051	TTA	2	6	45842	45847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009051	CG	3	6	47102	47107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_009051	TTC	2	6	47216	47221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_009051	TGGT	2	8	47269	47276	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009051	CCTC	2	8	47381	47388	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
86	NC_009051	CCG	2	6	47420	47425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_009051	CGC	2	6	47433	47438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_009051	GTC	2	6	47469	47474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_009051	C	6	6	47547	47552	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
90	NC_009051	TCG	2	6	47568	47573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_009051	GCC	2	6	47574	47579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_009051	CAC	2	6	47595	47600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_009051	CGC	2	6	47601	47606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_009051	GC	3	6	47605	47610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_009051	CTC	2	6	48842	48847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_009051	CGG	2	6	48864	48869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_009051	GAG	2	6	48874	48879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009051	T	7	7	49086	49092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009051	CCCT	2	8	52490	52497	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
100	NC_009051	CCCGG	2	10	52551	52560	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
101	NC_009051	GGT	2	6	53013	53018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009051	CGA	2	6	53071	53076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_009051	A	6	6	54689	54694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009051	CAA	2	6	54706	54711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_009051	AGT	2	6	54720	54725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009051	AGGA	2	8	54731	54738	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009051	GA	3	6	57969	57974	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009051	A	6	6	57989	57994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009051	TC	3	6	58019	58024	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_009051	GAA	2	6	58031	58036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009051	TC	3	6	58053	58058	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_009051	CGGGC	2	10	58070	58079	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
113	NC_009051	CCG	2	6	58084	58089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_009051	CGG	2	6	58835	58840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_009051	GCC	2	6	58857	58862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_009051	AT	4	8	58900	58907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009051	CGG	2	6	58954	58959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_009051	ACC	2	6	59002	59007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_009051	GGA	2	6	59038	59043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009051	CCG	3	9	62982	62990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_009051	ACG	2	6	62991	62996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_009051	ATT	2	6	64167	64172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009051	CAC	2	6	64173	64178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_009051	TA	3	6	64202	64207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009051	GTC	2	6	64224	64229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_009051	CGGC	2	8	64251	64258	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_009051	AAT	2	6	64951	64956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009051	TA	3	6	64958	64963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009051	TG	3	6	64964	64969	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009051	AG	3	6	66372	66377	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009051	ACG	2	6	66397	66402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_009051	CGG	2	6	66415	66420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_009051	CGGC	3	12	66424	66435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_009051	TTG	2	6	66439	66444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009051	GCCG	2	8	66482	66489	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_009051	CCTC	2	8	66499	66506	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
137	NC_009051	GCC	2	6	66555	66560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_009051	AG	3	6	72761	72766	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009051	TGA	2	6	72780	72785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009051	TGG	2	6	72818	72823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009051	TTC	2	6	72845	72850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_009051	AAC	2	6	72865	72870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_009051	GCTG	2	8	72875	72882	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_009051	GGT	2	6	72912	72917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009051	GCC	3	9	75718	75726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_009051	CT	3	6	75736	75741	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_009051	GAGTGC	2	12	76332	76343	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
148	NC_009051	TC	3	6	76353	76358	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_009051	CTTC	2	8	77101	77108	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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291	NC_009051	AGA	2	6	116986	116991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
292	NC_009051	CTG	2	6	117742	117747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
293	NC_009051	GTA	2	6	117766	117771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
294	NC_009051	TG	3	6	117824	117829	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
295	NC_009051	TTC	2	6	117847	117852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
296	NC_009051	CCT	2	6	117892	117897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
297	NC_009051	GATG	2	8	118138	118145	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
298	NC_009051	GTC	2	6	118230	118235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
299	NC_009051	GAAA	2	8	118260	118267	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
300	NC_009051	TC	3	6	118751	118756	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
301	NC_009051	GA	3	6	118800	118805	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
302	NC_009051	GTC	2	6	121269	121274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
303	NC_009051	CGATC	2	10	121332	121341	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
304	NC_009051	GGT	2	6	121349	121354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
305	NC_009051	GCA	2	6	121369	121374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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307	NC_009051	TGC	2	6	121517	121522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
308	NC_009051	TCCA	2	8	121597	121604	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
309	NC_009051	GAT	2	6	121618	121623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
310	NC_009051	T	6	6	122729	122734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
311	NC_009051	GCC	2	6	124637	124642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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313	NC_009051	GGA	2	6	125754	125759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
314	NC_009051	TGAAC	2	10	125762	125771	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
315	NC_009051	TAT	2	6	125823	125828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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329	NC_009051	GAA	2	6	130532	130537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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332	NC_009051	TCAA	2	8	133031	133038	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
333	NC_009051	C	6	6	134650	134655	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
334	NC_009051	CT	3	6	134670	134675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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336	NC_009051	CT	3	6	135204	135209	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
337	NC_009051	C	6	6	135212	135217	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
338	NC_009051	AC	3	6	135488	135493	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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373	NC_009051	TGCTCC	2	12	153592	153603	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
374	NC_009051	TCT	2	6	153623	153628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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412	NC_009051	C	6	6	161169	161174	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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420	NC_009051	CTG	2	6	161890	161895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
421	NC_009051	GATCC	2	10	161949	161958	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
422	NC_009051	TCTG	2	8	162001	162008	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
423	NC_009051	AGG	2	6	162796	162801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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425	NC_009051	GAA	2	6	163189	163194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
426	NC_009051	GAT	2	6	165047	165052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
427	NC_009051	ATCAG	2	10	165064	165073	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
428	NC_009051	CTG	2	6	167626	167631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
429	NC_009051	GTA	2	6	167725	167730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
430	NC_009051	CAC	2	6	167788	167793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
431	NC_009051	TGA	2	6	168288	168293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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433	NC_009051	AAAT	2	8	178130	178137	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_009051	AGG	2	6	182423	182428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
452	NC_009051	CCT	2	6	182506	182511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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462	NC_009051	GAG	2	6	188977	188982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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465	NC_009051	CTT	2	6	189183	189188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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475	NC_009051	CGG	2	6	191863	191868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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